Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HIP1O00291 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1O00291 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1O00291 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1O00291 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1O00291 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1O00291 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HIP1O00291 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HIP1O00291 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HIP1O00291 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1O00291 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1O00291 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1O00291 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1O00291 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HIP1O00291 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIP1O00291 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIP1O00291 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIP1O00291 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIP1O00291 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HIP1O00291 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIP1O00291 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HIP1O00291 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HIP1O00291 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HIP1O00291 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIP1O00291 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HIP1O00291 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HIP1O00291 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1O00291 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1O00291 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1O00291 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HIP1O00291 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIP1O00291 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIP1O00291 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIP1O00291 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIP1O00291 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIP1O00291 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HIP1O00291 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIP1O00291 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIP1O00291 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1O00291 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1O00291 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1O00291 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1O00291 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1O00291 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIP1O00291 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms