Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39AO00148 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX39AO00148 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX39AO00148 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX39AO00148 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms