Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPIPB6E9PJ23 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms