Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DIRC3C9JPN6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms