Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF879B4DU55 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms