Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B2RBV5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B2RBV5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B2RBV5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B2RBV5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B2RBV5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B2RBV5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B2RBV5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B2RBV5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B2RBV5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
B2RBV5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B2RBV5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
B2RBV5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B2RBV5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B2RBV5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B2RBV5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B2RBV5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B2RBV5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B2RBV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B2RBV5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B2RBV5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B2RBV5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B2RBV5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B2RBV5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B2RBV5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B2RBV5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B2RBV5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B2RBV5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B2RBV5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B2RBV5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B2RBV5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B2RBV5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B2RBV5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B2RBV5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B2RBV5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B2RBV5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
B2RBV5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B2RBV5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms