Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1LA8MT33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE1LA8MT33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms