Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJE1A6NN92 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJE1A6NN92 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJE1A6NN92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJE1A6NN92 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJE1A6NN92 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJE1A6NN92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJE1A6NN92 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJE1A6NN92 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJE1A6NN92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJE1A6NN92 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJE1A6NN92 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJE1A6NN92 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJE1A6NN92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJE1A6NN92 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJE1A6NN92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJE1A6NN92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJE1A6NN92 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJE1A6NN92 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJE1A6NN92 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms