Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIPT2A6NK58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms