Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GLTPD2A6NH11 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GLTPD2A6NH11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms