Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEMP2A6NFY4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEMP2A6NFY4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEMP2A6NFY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms