Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L3A6NCW0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L3A6NCW0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms