Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT1A5YKK6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT1A5YKK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT1A5YKK6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms