Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE9A4FU28 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTAGE9A4FU28 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTAGE9A4FU28 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms