Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF27A3QJZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF27A3QJZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms