Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIPSLA2A3N6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIPSLA2A3N6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms