Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC196A0A1B0GTZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC196A0A1B0GTZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms