Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SEW6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SEW6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0D9SEW6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SEW6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0D9SEW6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SEW6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms