Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYD5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0A6YYD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0A6YYD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0A6YYD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0A6YYD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0A6YYD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0A6YYD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0A6YYD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0A6YYD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms