Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV27A0A087WT01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV27A0A087WT01 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV27A0A087WT01 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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