Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms