Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M1Q9Y2T2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms