Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms