Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
L1RE1Q9UN81 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
L1RE1Q9UN81 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms