Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG3Q9UJ98 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms