Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEFF2Q9UIK5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms