Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms