Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM8A1Q9UBU6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms