Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC17A6Q9P2U8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC17A6Q9P2U8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms