Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGSF9Q9P2J2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGSF9Q9P2J2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms