Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC180Q9P1Z9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms