Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms