Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNK4Q9NYG8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms