Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms