Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms