Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00597Q9H2U6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00597Q9H2U6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms