Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NYXQ9GZU5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NYXQ9GZU5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms