Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSD3Q9BZ95 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms