Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms