Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLDIP3Q9BY77 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms