Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms