Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms