Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCMBPQ9BTE3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms