Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms