Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYCBPQ99417 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYCBPQ99417 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms