Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCZQ96LD1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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