Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT1Q96EB6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms