Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms