Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3C6Q969F1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms