Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRG4Q92954 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms